Hajdúszoboszló sa nachádza vo Východnom Maďarsku, vo východnej časti Veľkej Nížiny vo vzdialenosti 200 km od Budapešti a 20 km od Debrecínu.
Z hľadiska menšej geografickej jednotky leží na území Hajdúhátu, Hortobágyu a oblasti nazývanej Nagy-Sárrét a Berettyó. Geografický obraz mesta je určený v prvom rade ako nížina, ktorá je spestrená menšími a väčšími kopčekmi zeme, sprašnými a bahnovými oblasťami, ktorých výšková hladina sa vlnovite mení.
Vyplývajúc z nížinového charakteru okolitého prostredia je mesto v zimných a letných mesiacoch charakterizované teplým a suchým počasím. V letnom období je počet slnečných hodín vyslovene vysoký, čo je z hľadiska turizmu pre mesto veľmi priaznivé.
V protiklade k malémupomeru zrážok je pohyb vzduchuv v Hajdúszoboszló plynule spozorovateľný. Veľmi zriedkavo sa stáva, že v osade nefúka vietor. Vytvorenie charakteru liečebného miesta podporovala aj táto priaznivá klimatická podmienka.