Wystawy zapewniają interaktywne doświadczenie muzealne. Na wystawie historycznej zwiedzający mogą trzymać broń hajduków i pisać na tabliczce, na wystawie retro mogą wypróbować „symulator trabanta”, a na wystawie historii lokalnej mogą przymierzyć tradycyjne stroje mieszkańców. Podczas gdy wystawy sztuki prezentują dzieła Picassa i Chagalla, w Skarbcu Królewskim znajdują się kopie Korony i Berła Bocskai.
W nowym budynku Muzeum Bocskai, zwanym Królewskim Skarbcem, zwiedzający mogą zobaczyć szlachetne i autentyczne kopie korony i berła transylwańskiego księcia Istvána Bocskai, który osiedlił Hajduków w Soboszlo. „Święta korona Hajduków” jest prawdziwą tajemnicą: jej pochodzenie jest wątpliwe, jej rola sporna, jej własność niejasna. Mogła zostać wykonana w warsztatach bizantyjskich, tureckich lub perskich. Jest to jedyna korona, z którą transylwański książę został koronowany na węgierskiego króla, choć tylko niektórzy historycy to akceptują. Korona Bocskai była symbolem potęgi jednego z największych węgierskich władców, a Habsburgowie obawiali się jej tak bardzo, że po śmierci księcia zabrali ją do Wiednia. Jej oryginał pozostaje tam do dziś, choć zarówno państwo węgierskie, jak i rumuńskie nadal roszczą sobie do niej prawo. W Hajdúszoboszló znajduje się jednak jego cenna replika.
W ogrodzie Muzeum Bocskai znajduje się wystawa historii rolnictwa, pokazująca ciągły rozwój techniczny od XIX wieku. Kolejną wyjątkową atrakcją są aluminiowe dzwony Edit Oborzil i jej męża Tibora Jeneya, które zostały przekazane miastu Hajdúszoboszló. Dzwony z symbolicznej dzwonnicy miasta są również częścią tej kolekcji.
W głównym budynku wielobudynkowego Muzeum Bocskai znajduje się wystawa stała Hajdúszoboszló historia miasta. Wyjątkową rzadkością w muzeum jest flaga Bocskai, która została podarowana przez księcia wojownikom Hajdú i została zachowana w Muzeum Bocskai István. Jako pamiątka przeszłości, herb na fladze można również znaleźć na liście przywilejów „szoboszló” Hajdúszoboszló Hajdú Hajdúszoboszló oraz na obecnym herbie miasta Hajdúszoboszló.
Wystawa jest bardzo zróżnicowana, w tym obraz księcia Istvána Bocskai autorstwa Jánosa Szűtsa, a także naczynia, relikwie wojenne i relikwie słynnych mieszkańców miasta - Ernő Szép, Ferenc Pávai-Vajna. Inne interesujące eksponaty obejmują kolekcję owadów i motyli typowych dla regionu Hajdúság.
Więcej informacji na temat aktualnie prezentowanych wystaw można znaleźć na stronie Muzeum Bocskai na stronie internetowej.